CZ-OPENSCREEN, celým názvem Národní infrastruktura chemické biologie, je velká výzkumná infrastruktura provozována Ústavem molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. CZ-OPENSCREEN provozuje v rámci České republiky nejmodernější výzkumnou infrastrukturu v oblastech chemické biologie a genetiky s možností otevřeného přístupu externím uživatelům. CZ-OPENSCREEN prezentuje Českou republiku v konsorciu evropské výzkumné infrastruktury EU-OPENSCREEN ERIC, jehož první ustavující zasedání proběhlo 12. dubna 2018 v Berlíně.
CZ-OPENSCREEN má v rámci EU-OPENSCREEN nezastupitelnou a opravdu výjimečnou roli. Náročným procesem evaluace byl Ústav molekulární genetiky vybrán jako hostitelská instituce Evropské chemicko-biologické databáze (ECBD). Tato skvělá zpráva byla oznámena právě na výše zmíněném zasedání v Berlíně, a tak 12. duben 2018 je pro tento český uzel konsorcia dnem červeně zvýrazněným v kalendáři.
V databázi ECBD budou uloženy všechny výstupy z partnerských center konsorcia EU-OPENSCREEN, jako jsou data z testování s vysokou propustností (HTS) či struktury chemických sloučenin. Všechna tato data budou zpřístupněna na bázi otevřeného přístupu široké vědecké veřejnosti. Než dojde k jejich zpřístupnění, budou procházet nezbytným procesem ověřování a kontrolou kvality, teprve poté budou vypuštěna do světa. O jejich validaci se postarají nejprve partnerské instituce, ve kterých budou tato data vznikat, a následně pražský ECBD tým. Přátelské uživatelské prostředí by mělo umožnit jednoduché i pokročilejší (s možností přesného nastavení parametrů) vyhledávání a identifikaci uživatelsky definovaných datových množin.
Součástí databáze budou také nástroje pro analýzu nashromážděných dat, aby je jak začátečníci, tak pokročilí uživatelé byli schopni plně využít. Kromě běžné uživatelské podpory ECBD týmu bude ECBD web nabízet i interaktivního průvodce s přehledem hlavních funkcí a popisem zobrazovaných dat. Nastřádaná, ověřená data budou dále z ECBD předávána do databáze ChEMBL, za účelem zvýšení jejich dostupnosti. Je důležité poznamenat, že o hardwarové zázemí a bezpečné prostředí ECBD se bude starat CESNET - národní e-infrastruktura, která poskytuje široké spektrum služeb pro přenos, ukládání a zpracování dat, spravuje také velká datová úložiště pro ukládání a sdílení dat. Zapojení CESNETu do projektu ECBD je skvělým příkladem spolupráce Velkých infrastruktur na národní úrovni.
Nezbývá než popřát ECBD týmu hodně kvalitních dat a vědecké veřejnosti hodně nápadů, jak tato data využít pro další výzkum. Infrastruktury totiž existují především jako pomoc pro ty, kteří si náročné technologie a testování nemohou dovolit. Jejich úkolem je tyto věci umožnit a posouvat tak znalosti o našem světě dál až třeba k novým léčivům.
Infrastruktura CZ-OPENSCREEN je podpořena z programu MŠMT: LM - Projekty velkých infrastruktur pro VaVaI (2010-2017), číslo projektu LM2015063.
https://www.vyzkumne-infrastruktury.cz
AVČR a NejBusiness.cz
22.4.2018
Direct pojišťovna potvrzuje svou dlouhodobou pozici mezi nejrychleji rostoucími pojišťovnami na trhu....
Od 18. března 2024 do 15. dubna 2024 bude Komerční banka vyplácet zjištěné pohledávky věřitelů Sberbank CZ...
Společnost DKV Mobility, přední evropská B2B platforma pro platby a řešení na cestách, rozšířila svou...
Po představení své nové obchodní strategie, zaměřené na podporu zdraví, správného stravování a na...
Společnost SAP oznámila novinky zaměřené na správu firemních dat. Nejvíce inovací včetně využití...
Společnost Dell uvádí na trh zcela novou řadu Latitude s podporou umělé inteligence. Notebooky vybavené...
Mozaika nájemců ve vysočanském věžáku AFI City 1 je již kompletně dokončená. Mezi nové přírůstky mimo jiné...
V průmyslovém parku v Banské Bystrici bylo úspěšně uvedeno do provozu největší smart bateriové úložiště na...
Obchodní řetězec PENNY pokračuje ve zvyšování mezd, ty od 1. března stouply bezmála sedmi tisícovkám...
Na letní dovolenou do zahraničí cestují čeští turisté nejčastěji autem (48 %), dále letecky (41 %),...